Chile y Perú suscribieron un tratado de libre comercio el 22 de agosto de 2006. Este Acuerdo reemplaza el texto, anexos y protocolos del Acuerdo de Complementación Económica Nº 38 (registrado en ALADI como AAP.CE Nº 38), que había sido firmado el 22 de junio de 1998 y entrado en vigencia el 1o de julio de 1998.
Chile y Perú comenzaron conversaciones para renegociar este acuerdo en el 2004 con la finalidad de profundizar sus relaciones comerciales. El Segundo Protocolo Adicional, suscrito el 17 de febrero de 2005, disponía la aceleración del programa de liberación previsto inicialmente en el Acuerdo.